A vezérlőrendszer a függőleges megmunkálóközpont központi eleme. Fogadja a kezelői parancsokat és vezérli a különböző gépelemek mozgását. A vezérlőrendszerek jellemzően nagy-precíziós CNC-rendszereket használnak, lehetővé téve az összetett megmunkálási utakat és a precíz pozicionálást. A vezérlőrendszer pontos vezérlésével a függőleges megmunkálóközpontok nagy-precíziós megmunkálást érhetnek el, jelentősen javítva ezzel a termelés hatékonyságát és minőségét.
